Публикации

1. 1. Клиент-серверная платформа совместных кроссплатформенных вычислений на основе модулей WebAssembly : регистрация программы для ЭВМ [патент]
   Байгин Матвей Маратович, Шубин Антон Дмитриевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
   2024
2. 2. Программное обеспечение для интерпретации модулей WebAssembly без системных и аппаратных зависимостей : регистрация программы для ЭВМ [патент]
   Шубин Антон Дмитриевич, Байгин Матвей Маратович, Кузьмин Дмитрий Александрович
   2023
3. 3. Программное обеспечение для трехмерной визуализации рельефа и элементов инфраструктуры в реальном времени для настольных платформ с возможностью отображения в веб-браузере : регистрация программы для ЭВМ [патент]
   Шубин Антон Дмитриевич, Байгин Матвей Маратович, Кузьмин Дмитрий Александрович
   2022
4. 4. Annotation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Nuclear Genome—One of the Most Cold-Resistant Tree Species in the Only Deciduous GENUS in Pinaceae [статья из журнала]
   Bondar E. I., Feranchuk S. I., Miroshnikova K. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
   2022, Plants
5. 5. ANNOTATION OF SIBERIAN LARCH REFERENCE GENOME, THE ONLY SEASONAL SENESCENCE GENUS IN PINACEAE : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Bondar E. I., Feranchuk S. I., Miroshnikova K. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
   2022, Высокопроизводительное секвенирование в геномике (HSG-2022)
6. 6. De Novo Transcriptome Assembly and Annotation of a New Plant Pathogenic Corinectria sp. Strain in Siberia : научное издание [статья из журнала]
   Biriukov V. V., Pavlov I. N., Litovka Yu. A., Oreshkova N. V., Sharov V. V., Simonov E. P., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
   2022, Микология и фитопатология
7. 7. Annotation of Siberian larch genome draft assembly : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Bondar E. I., Feranchuk S. I., Birukhov V. V., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
   2021, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology
8. 8. Repetitive elements in the genome of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
   Miroshnikova K. A., Biriukov V. V., Kuzmin D. A., Sadovsky M. G., Bondar E. I., Putintseva Y. A., Krutovsky Konstantin V., Akulova V. S., Sharov V. V., Oreshkova N. V.
   2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020)
9. 9. Параллельная программа для вычисления функций роста бернсайдовых двупорожденных групп на GPU : регистрация программы для ЭВМ [патент]
   Тарасов Сергей Александрович, Кузнецов Александр Алексеевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
   2020
10. 10. Программа для автоматизации деятельности сервисного центра : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Кузьмин Дмитрий Александрович, Назарова Софья Александровна, Эмилбек кызы Земфира, Макуха Любовь Витальевна, Сидоров Анатолий Юрьевич, Гриул Артем Игоревич
    2020
11. 11. LIBRARY OF MATHEMATICAL FUNCTIONS WITH PARALLELISM AT THE OPERATIONAL LEVEL IN THE PYTHAGOR LANGUAGE : научное издание [статья из журнала]
    Udalova J. V., Kuzmin D. A., Кузнецов А. А. (рец.)
    2019, Сибирский журнал науки и технологий
12. 12. Assembling of the Siberian larch mitochondrial genome using long nucleotide sequence reads, the largest currently known mitogenome : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Y. A., Bondar E. I., Sharov V. V., Simonov E. P., Oreshkova N. V., Kuzmin D. A., Sadovsky M. G., Krutovsky K. V.
    2019, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology (PlantGen2019)
13. 13. Development of Nuclear Microsatellite Markers with Long (Tri-, Tetra-, Penta-, and Hexanucleotide) Motifs for Three Larch Species Based on the de novo Whole Genome Sequencing of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) [статья из журнала]
    Oreshkova N. V., Bondar E. I., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2019, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
14. 14. Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и шестинуклеотидными) мотивами для трех видов лиственницы на основе полногеномного de novo секвенирования лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) : научное издание [статья из журнала]
    Орешкова Н. В., Бондар Е. И., Путинцева Ю. А., Шаров В. В., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В.
    2019, Генетика
15. 15. Программа фильтрации избыточных последовательностей геномов в формате FASTA : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2018
16. 16. Программный комплекс мониторинга изменений в файловой системе под управлением операционной системы Linux : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2018
17. 17. Программный комплекс для объединения результатов поиска SNP в геномах : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2018
18. 18. О ЗАДАЧЕ ИМИТАЦИОННОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ РАБОТЫ СЕКВЕНАТОРА NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Шаров В. В., Кобец В. А., Кузьмин Д. А., Ходос Г. А., Садовский М. Г.
    2018, Нейроинформатика, её приложения и анализ данных
19. 19. Программа симуляции геномных данных с повторами : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Цыбин Александр Николаевич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2017
20. 20. Комплекс предобработки ридов NGS : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Маколов Степан Викторович, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2017
21. 21. СБОРКА И АННОТИРОВАНИЕ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Шаров В. В., Путинцева Ю. А., Кузьмин Д. А., Орешкова Н. В., Феранчук С. И., Цыбин А. Н., Маколов С. В., Крутовский К. В.
    2017, Высокопроизводительное секвенирование в геномике
22. 22. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus : научное издание [статья из журнала]
    Moskalev A. A., Kudryavtseva A. V., Graphodatsky A. S., Beklemisheva V. R., Serdyukova N. A., Krutovsky K. V., Sharov V. V., Kulakovskiy I. V., Lando A. S., Kasianov A. S., Kuzmin D. A., Putintseva Y. A., Feranchuk S. I., Shaposhnikov M. V., Fraifeld V. E., Toren D., Snezhkina A. V., Sitnik V. V.
    2017, BMC Evolutionary Biology
23. 23. РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ : научное издание [статья из журнала]
    Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В.
    2017, Генетика
24. 24. Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) Based on the de novo Whole Genome Sequencing : научное издание [статья из журнала]
    Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2017, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
25. 25. ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АННОТАЦИЯ ГЕНОМА ЛИСТВЕННИЦЫ КАК ПОДХОД К ПРОЯСНЕНИЮ МЕХАНИЗМОВ ФОРМИРОВАНИЯ ВАЖНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Феранчук Сергей Ильич, Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович, Орешкова Наталья Викторовна, Крутовский Константин Валерьевич
    2017, Сохранение лесных генетических ресурсов
26. 26. Программа для индексирования геномных последовательностей большого размера методом "FM-index" на графических ускорителях : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2016
27. 27. STUDY OF ARMILLARIA BOREALIS PATHOGENICITY BY THE COMPARATIVE WHOLE GENOME SEQUENCING : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Yu. A., Pavlov I. N., Oreshkova N. V., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Makolov S. V., Krutovsky K. V.
    2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
28. 28. SEQUENCING OF CONIFER GENOMES USING NGS : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Krutovsky K. V.
    2016, The tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology
29. 29. Разработка микросателлитных маркеров сосны кедровой сибирской (italicPinus sibirica/italic Du Tour) по результатам полногеномного italicde novo/italic секвенирования : научное издание [статья из журнала]
    Белоконь М. М., Кузьмин Д. А., Крутовский К. В., Политов Д. В., Мудрик Е. А., Полякова Т. А., Шатохина А. В., Белоконь Ю. С., Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В.
    2016, Генетика
30. 30. ПАРАЛЛЕЛЬНЫЙ АЛГОРИТМ ФИЛЬТРАЦИИ ПОВТОРОВ В ДАННЫХ NGS ILLUMINA : научное издание [статья из журнала]
    Цыбин Александр Николаевич, Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Феранчук Сергей Ильич, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2016, Доклады Академии наук высшей школы Российской Федерации
31. 31. ИССЛЕДОВАНИЕ МЕТОДОВ ОЦЕНКИ ЭФФЕКТИВНОСТИ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ СИСТЕМ НА ОСНОВЕ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ МОДЕЛЕЙ [статья из журнала]
    Астриков Д. Ю., Кузьмин Д. А.
    2016, Вестник Сибирского государственного аэрокосмического университета им. академика М.Ф. Решетнева
32. 32. Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du Tour) Based on the de novo Whole Genome Sequencing [статья из журнала]
    Belokon M. M., Politov D. V., Mudrik E. A., Polyakova T. A., Shatokhina A. V., Belokon Yu. S., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Krutovsky K. V.
    2016, RUSSIAN JOURNAL OF GENETICS
33. 33. Секвенирование и сборка геномов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) и предварительные данные анализа транскриптома : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Кузьмин Д. А., Шаров В. В., Бирюков В. В., Дейч К. О., Ибе A. A., Шилкина E. A., Крутовский К. В.
    2015, Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири
34. 34. Программный комплекс для определения размера библиотек (insert size) парных ридов NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2015
35. 35. Программный комплекс по подготовке ридов NGS Illumina к ассемблированию : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Шаров Вадим Витальевич, Цыбин Александр Николаевич, Маколов Степан Викторович, Кузьмин Дмитрий Александрович
    2015
36. 36. Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательностей (рипитов) в ридах NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ [патент]
    Цыбин Александр Николаевич, Кузьмин Дмитрий Александрович, Феранчук Сергей Ильич, Путинцева Юлия Андреевна
    2015
37. 37. CHALLENGES OF ASSEMBLING HUGE CONIFER GENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Putintseva Yu. A., Sharov V. V., Kuzmin D. A., Makolov S. V., Oreshkova N. V., Krutovsky K. V.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
38. 38. THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Deych K. O., Ibe A. A., Shilkina E. A., Krutovsky K. V.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
39. 39. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Krutovsky K. V., Oreshkova N. V., Putintseva Yu. A., Kuzmin D. A., Sharov V. V., Biryukov V. V., Makolov S. V., Deych K. O., Bondar E. I., Ushakova O. A., Ibe A. A., Shilkina E. A.
    2015, Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology
40. 40. СИСТЕМА КЛИЕНТСКОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ ОБЛАЧНОЙ РЕНДЕРФЕРМЫ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Никитин В. Н., Кузьмин Д. А.
    2014, СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ТЕХНИЧЕСКИХ НАУК
41. 41. МОДЕЛИРОВАНИЕ СИСТЕМЫ ПЛАНИРОВАНИЯ РАСПРЕДЕЛЕННОГО ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОГО КОМПЛЕКСА [статья из журнала]
    Астриков Дмитрий Юрьевич, Кузьмин Дмитрий Александрович, Панасюк Александр Иванович
    2014, Доклады Академии наук высшей школы Российской Федерации
42. 42. ВИЗУАЛИЗАЦИЯ ТРЕХМЕРНЫХ МОДЕЛЕЙ НА СУПЕРКОМЬЮТЕРНЫХ РЕСУРСАХ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    ПАНАСЮК А. И., МАКОЛОВ С. В., АСТРИКОВ Д. Ю., КУЗЬМИН Д. А.
    2012, Научный сервис в сети Интернет: поиск новых решений
43. 43. СОЗДАНИЕ GRID-СЕРВИСА ДЛЯ ПРЕДОСТАВЛЕНИЯ ДОСТУПА К СУПЕРКОМПЬЮТЕРУ СФУ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Астриков Д. Ю., Белоусов А. Н., Кузьмин Д. А.
    2011, Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее
44. 44. ОРГАНИЗАЦИЯ GRID-ИНФРАСТРУКТУРЫ ДЛЯ ПРЕДОСТАВЛЕНИЯ СЕРВИСОВ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫХ ВЫЧИСЛЕНИЙ НАУКОЕМКИМ ПРЕДПРИЯТИЯМ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Астриков Д. Ю., Белоусов А. Н., Кузьмин Д. А.
    2011, Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее
45. 45. СОЗДАНИЕ КЛАСТЕРНОГО ГРИДА НА БАЗЕ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫХ РЕСУРСОВ СФУ : доклад, тезисы доклада [доклад, тезисы доклада, статья из сборника материалов конференций]
    Маколов С. В., Кузьмин Д. А., Бугай А. П.
    2010, Научный сервис в сети Интернет: суперкомпьютерные центры и задачи
46. 46. Компьютерные алгоритмы теоретико-множественного анализа сложных алгебраических систем : монография [монография]
    Кузнецов Александр Алексеевич, Кузьмин Дмитрий Александрович, Лыткина Дарья Викторовна, Тухватуллина Ляйсан Ринатовна, Филиппов К. А.
    2009
47. 47. Исследование и разработка методов выполнения функционально-параллельных программ : диссертация на соискание ученой степени кандидата технических наук [диссертация]
    Кузьмин Дмитрий Александрович
    2004
48. 48. Исследование и разработка методов выполнения функционально-параллельных программ : автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук [автореферат диссертации]
    Кузьмин Дмитрий Александрович
    2004