11 апреля 2007 года Государственной Думой был принят во 2 чтении проект федерального закона «О внесении изменений в Бюджетный кодекс Российской Федерации в части регулирования бюджетного процесса и приведении в соответствие с бюджетным законодательством Российской Федерации отдельных законодательных актов Российской Федерации».
В результате активных консультаций и поддержки позиции Российского Союза ректоров руководством Администрации Президента России, Министерства образования и науки, Федерального агентства по образованию, Государственной Думы и Счетной палаты в законопроект были внесены поправки, сохраняющие действующую систему финансирования учреждений образования, построенную на принципах сочетания бюджетных и внебюджетных источников.